Plan de recherche et de développement en santé des végétaux
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Plan de recherche et de développement en santé des végétaux

Jun 09, 2023

Mis à jour le 18 mai 2023

© Copyright de la Couronne 2023

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Ce plan définit les besoins de recherche et de développement en matière de santé des plantes du ministère de l'Environnement, de l'Alimentation et des Affaires rurales (Defra) et décrit notre approche pour les mettre en œuvre au cours des 5 prochaines années, de 2023 à 2028. Il a été élaboré avec les parties prenantes, y compris les utilisateurs. et les fournisseurs de recherche et de développement en santé des végétaux, afin de fournir une feuille de route qui communique et partage nos priorités futures avec les autres.

Les termes « nous » et « notre » sont référencés tout au long de ce plan et dans tous les cas, cela fait référence au Defra.

Ce plan soutient la livraison par le Defra de la stratégie de biosécurité végétale pour la Grande-Bretagne (2023 à 2028) publiée en janvier 2023, en particulier le résultat 4 : Une capacité technique renforcée. Il soutiendra également la mise en œuvre de la stratégie de résilience de la santé des arbres du Defra (2018), dont la mise à jour est prévue plus tard en 2023.

Le plan identifie et vise à réaliser 4 objectifs stratégiques de recherche et développement en santé des végétaux. Ces objectifs stratégiques visent à :

Nous avons organisé les besoins de recherche et développement en santé des plantes en 6 thèmes de recherche. Chaque thème est divisé en domaines d'intervention avec des questions de recherche indicatives pour aider à décrire nos priorités actuelles :

Enfin, le plan décrit notre approche prévue pour atteindre nos objectifs stratégiques à travers :

Nous décrivons ensuite comment nous gérons les projets tout au long du cycle de projet pour fournir des extrants et des résultats de la plus haute qualité.

Ce plan de recherche et de développement en santé des plantes résume la façon dont Defra répond actuellement à ses besoins de recherche et de développement en santé des plantes et identifie nos priorités pour l'avenir. Il s'agit notamment de soutenir la livraison de la stratégie de biosécurité végétale pour la Grande-Bretagne (2023 à 2028) et du successeur de la stratégie de résilience de la santé des arbres (2018). Le plan développe les détails publiés dans les intérêts de recherche et d'innovation du groupe Defra (2021). Il guidera la mise en service de la recherche sur la santé des plantes du Defra pour les 5 prochaines années, ainsi que les priorités de nos programmes de recherche et de nos partenariats.

Certains aspects de la gestion continue des ravageurs et des maladies des plantes sont dirigés par d'autres équipes du Defra, en particulier ceux liés aux cultures et à la production alimentaire. Nous décrivons brièvement comment nous travaillons et coordonnons avec ces activités plus larges au chapitre 2.

Le plan a été élaboré en collaboration avec les parties prenantes, y compris les utilisateurs et les fournisseurs de connaissances et de technologies phytosanitaires. En partageant nos plans, nous visons à communiquer clairement et à partager nos priorités futures avec les autres. De plus, on espère que cette feuille de route éclairera également les décisions d'investissement des bailleurs de fonds de la recherche et les priorités des chercheurs afin de tirer parti d'un impact supplémentaire au-delà de celui de la recherche que le Defra commande directement.

Nos plantes et nos arbres sont un capital naturel vital. Ils ont une valeur annuelle estimée à 15,7 milliards de livres sterling par an, si l'on considère les avantages économiques, environnementaux et sociaux qu'ils procurent au Royaume-Uni. Cela inclut la valeur de nos cultures agricoles et horticoles qui sont vitales pour la sécurité alimentaire, la foresterie commerciale et la valeur sociale, la biodiversité et la séquestration du carbone des plantes dans nos paysages. En 2021, environ 21,5 millions de tonnes de végétaux et de produits végétaux, d'une valeur de 15,8 milliards de livres sterling, ont été importées et exportées entre le Royaume-Uni et le reste du monde. Cependant, les ravageurs et les maladies représentent un risque croissant pour ces actifs de capital naturel et ces valeurs commerciales. Au niveau mondial, l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture estime que chaque année, jusqu'à 40 % de la production agricole est perdue à cause des ravageurs. Chaque année, les maladies des plantes coûtent à l'économie mondiale plus de 220 milliards de dollars et les insectes envahissants au moins 70 milliards de dollars. Les menaces accrues pour la biosécurité des plantes ont été attribuées à plusieurs facteurs, notamment le changement climatique et l'augmentation du commerce et des voyages mondiaux, qui offrent davantage de voies d'entrée pour les ravageurs et les maladies.

Depuis la publication de la première stratégie de biosécurité végétale pour la Grande-Bretagne (2014), le gouvernement britannique a accordé une importance élevée et croissante à la protection de nos plantes contre ces risques en utilisant une approche fondée sur des preuves.

En 2023, Defra, en collaboration avec le gouvernement écossais, le gouvernement gallois et la Forestry Commission, a publié une stratégie actualisée de biosécurité végétale pour la Grande-Bretagne (2023 à 2028). Celui-ci a pour vision de "protéger les plantes de Grande-Bretagne grâce à un partenariat solide entre le gouvernement, l'industrie et le public, travaillant ensemble pour réduire et gérer les risques posés par les phytoravageurs et les agents pathogènes, et faciliter un commerce sûr".

Le gouvernement réalisera cette vision à travers 4 résultats :

Le nouveau plan d'amélioration de l'environnement du Defra (2023) et son prédécesseur reconnaissent également la nécessité de renforcer la biosécurité pour protéger notre faune et notre bétail et renforcer la résilience de nos plantes et de nos arbres. Il est soutenu par la stratégie de résilience de la santé des arbres (2018) qui vise à renforcer la résilience des arbres, des bois et des forêts d'Angleterre afin d'améliorer les avantages que les arbres fournissent, en atténuant et en minimisant l'impact des ravageurs et des maladies et en améliorant la capacité des arbres à s'adapter. aux pressions changeantes.

Les risques phytosanitaires sont également reconnus dans la stratégie de sécurité biologique du Royaume-Uni (qui doit être actualisée en 2023) qui fournit le cadre stratégique global pour protéger le Royaume-Uni contre les menaces biologiques importantes d'origine naturelle, accidentelle et délibérée et vise à ce que le Royaume-Uni soit résilient face aux l'éventail complet des menaces biologiques. Cela correspond à l'approche One Health du gouvernement britannique qui vise à atteindre des résultats de santé holistiques pour les personnes, les animaux, les plantes et l'environnement.

Le UK Plant Health Service (PHS) est composé du Defra, du gouvernement écossais, du gouvernement gallois, de Daera et de la Forestry Commission et est soutenu par l'Agence pour la santé animale et végétale (APHA). Le travail du UK PHS est défini dans UK plant health: provision common framework et supervisé par l'Organisation nationale de la protection des végétaux (ONPV) et ses sous-groupes, le Plant Health Outbreak Readiness Board et le Plant Health Risk Group. Répondre aux besoins de recherche et de développement du Defra est essentiel à l'efficacité de ces structures opérationnelles. De plus amples détails sur ce processus sont fournis dans le chapitre suivant.

En outre, la participation aux processus et organes internationaux exige du Defra qu'il soutienne la prise de décision fondée sur des preuves et l'établissement de règles et de normes. Par exemple, l'accord sanitaire et phytosanitaire (SPS) qui régit le commerce international exige que toute mesure mise en œuvre soit fondée sur des principes scientifiques et ne soit pas maintenue sans preuves scientifiques suffisantes. De même, la Convention internationale pour la protection des végétaux (CIPV), qui est un traité phytosanitaire international visant à prévenir l'introduction et la propagation d'organismes nuisibles, exige que les mesures phytosanitaires introduites pour les organismes de quarantaine et les organismes réglementés non de quarantaine soient techniquement justifiées.

Defra investit dans la recherche et le développement phytosanitaires pour atteindre des objectifs stratégiques. Ces objectifs stratégiques visent à :

Ces documents politiques et nos objectifs stratégiques de recherche et développement forment la base des 6 thèmes de recherche :

Ces thèmes sont décrits en détail au chapitre 3.

Certains des besoins de recherche et de développement phytosanitaires du Defra sont satisfaits par des scientifiques et des analystes du département. Cependant, la plupart des besoins sont satisfaits en travaillant avec la communauté de recherche nationale et internationale, les utilisateurs, les parties prenantes et d'autres bailleurs de fonds pour identifier, soutenir et répondre aux besoins prioritaires.

En réponse à ces vastes besoins, nous soutenons un large portefeuille d'activités interdisciplinaires qui combinent une recherche stratégique à long terme avec des approches plus appliquées et réactives.

Depuis 2014, plus de 34 millions de livres sterling ont été investis dans le programme de recherche et de développement phytosanitaire du Defra. Des investissements continus sont nécessaires pour améliorer notre capacité technique et rester au fait des menaces changeantes et des mesures d'atténuation potentielles, afin de nous assurer que nous sommes prêts pour l'avenir. D'avril 2022 à mars 2023, Defra a investi 6 millions de livres sterling et soutenu près de 100 activités de recherche. Ces activités étaient dirigées par 12 organisations principales, mais impliquaient beaucoup plus de partenaires de recherche et de collaborations entre parties prenantes, y compris des partenariats avec des organisations de 31 pays à travers le monde.

Forest Research et Fera Science Ltd continuent de fournir au gouvernement une capacité de recherche essentielle sur la santé des végétaux et ont mené le plus grand nombre de projets au cours de l'exercice 2022 à 2023, avec d'autres principaux fournisseurs de recherche, notamment :

Ces principaux fournisseurs de recherche ont obtenu un soutien supplémentaire de la part d'un groupe beaucoup plus large de fournisseurs de recherche, notamment des universités, des organismes de recherche et des organisations non gouvernementales, comme indiqué dans la figure 1. Le Defra a cofinancé le programme sur les maladies bactériennes des plantes du Conseil de recherche en sciences biologiques (BBSRC), aidant pour mobiliser environ 13 millions de livres sterling de financement de l'UKRI vers les priorités de la santé des végétaux. Le programme distribue des fonds à des organisations telles que l'Institut national de botanique, Fera Science Ltd, l'Institut James Hutton, Forest Research, ainsi qu'à plusieurs universités et autres sous-traitants.

1. Recherche forestière – plus de 1 000 000 £ 2. Met Office – entre 100 000 £ et 999 999 £ 3. Comité conjoint pour la conservation de la nature (JNCC) – entre 100 000 £ et 999 999 £ 4. Jardins botaniques royaux de Kew – entre 100 000 £ et 999 999 £ 5. Fera Science Ltd - entre 100 000 £ et 999 999 £

6. National Institute of Agricultural Botany (NIAB) – entre 10 000 £ et 49 999 £ 7. UK Centre for Ecology and Hydrology (UKCEH) – entre 100 000 £ et 999 999 £ 8. James Hutton Institute – entre 10 000 £ et 49 999 £ 9. Rothamsted Recherche - entre 10 000 £ et 49 999 £

10. Financement de contrepartie pour le programme Bacterial Plant Disease Program dirigé par le Biological Sciences Research Council (BBSRC) – entre 100 000 £ et 999 999 £ 11. Soutien au programme Treescapes du Natural Environment Research Council (NERC) – entre 50 000 £ et 99 999 £

12. Gloucestershire University – entre 10 000 £ et 49 999 £ 13. Cambridge University – entre 10 000 £ et 49 999 £ 14. Aberystwyth University – entre 10 000 £ et 49 999 £ 15. Exeter University – entre 100 000 £ et 999 999 £ 16. Warwick University – entre 10 000 £ et 49 999 £ 17. Université de Bangor – moins de 10 000 £ 18. Université de York – entre 10 000 £ et 49 999 £ 19. Université de Birmingham – entre 50 000 £ et 99 999 £ 20. Université de Glasgow – entre 10 000 £ et 49 999 £ 21. Université de Sheffield – entre 10 000 £ et 49 999 £ 22. Université de Durham – entre 10 000 £ et 49 999 £ 23. Université de Strathclyde – entre 10 000 £ et 49 999 £ 24. Université de Newcastle – entre 10 000 £ et 49 999 £ 25. Université Queen Mary – entre 10 000 £ et 49 999 £ 26. Université de Salford – entre 10 000 £ et 49 999 £ 27. Université d'Aberystwyth – entre 50 000 £ et 99 999 £ 28. Université de Reading – entre 50 000 £ et 99 999 £ 29. Université de Southampton – entre 100 000 £ et 999 999 £ 30. Université de St Andrews – entre 100 000 £ et 999 999 £

31. Rezatec – entre 10 000 £ et 49 999 £

32. Sylva Foundation – entre 10 000 £ et 49 999 £ 33. Tree Council – entre 50 000 £ et 99 999 £ 34. Plant Health Alliance – moins de 10 000 £ 35. Woodland Heritage – entre 10 000 £ et 49 999 £ 36. Future Trees Trust – moins de £ 10 000 37. Woodland Trust – entre 10 000 £ et 49 999 £ 38. Botanic Gardens Conservation International (BGCI) – entre 100 000 £ et 999 999 £

Les activités de recherche répondent à une gamme d'exigences de recherche, y compris l'analyse des risques et de l'horizon, le développement de nouvelles approches de surveillance et de diagnostic, la modélisation et la gestion des ravageurs et des maladies, la construction de paysages résilients, la compréhension des comportements et l'évaluation des politiques (figures 2 et 3). Un peu moins de la moitié des projets de l'exercice 2022 à 2023 concernaient un seul ravageur ou pathogène. Des exemples notables incluent Phytophthora, le dépérissement du frêne, l'agrile du frêne, Xylella, la brûlure du châtaignier et la processionnaire du chêne. Environ 21 % des projets étaient axés sur plusieurs ravageurs ou pathogènes, et 31 % n'étaient pas directement liés aux ravageurs ou aux pathogènes.

Figure 2 : Nombre de projets actifs dans tous les thèmes de recherche pour l'exercice 2022 à 2023, avec 22 projets pour le thème 1 : risque et analyse prospective, 27 projets pour le thème 2 : inspections, diagnostics et surveillance, 19 projets pour le thème 3 : gestion des ravageurs et maladies, 15 projets pour l'axe 4 : résilience et adaptation, 6 projets pour l'axe 5 : comportements phytosanitaires et 5 projets pour l'axe 6 : évaluation.

Figure 3 : Proportion des dépenses dans les thèmes de recherche pour l'exercice 2022 à 2023. Sur les dépenses totales, le thème 1 : évaluation des risques et analyse prospective représentait 16 %, le thème 2 : inspections, diagnostics et surveillance représentaient 13 %, le thème 3 : gestion des ravageurs et maladies pour 27%, thème 4 : résilience et adaptation pour 24%, thème 5 : comportements phytosanitaires pour 10% et thème 6 : évaluation pour 10%.

Future Proofing Plant Health (FPPH) a été créé en 2014 dans le cadre d'une collaboration entre Defra, Fera Science Ltd, Forest Research, Royal Botanic Gardens Kew, Joint Nature Conservation Committee et Natural England, pour consolider les exigences de recherche et de développement en matière de santé des plantes fournies par les organisations du réseau Defra. et encourager une plus grande collaboration entre les principaux fournisseurs scientifiques du ministère. Jusqu'à 20 % du financement du projet est disponible pour sous-traiter une expertise externe afin de créer des réseaux et des capacités. Aujourd'hui, il fournit près de 3 millions de livres sterling de financement par an à ces principaux fournisseurs de recherche et à leurs collaborateurs tiers, avec des projets individuels qui durent généralement jusqu'à 3 ans et reçoivent un financement pouvant atteindre 250 000 £. Quelques exemples de projets sont fournis dans l'étude de cas 1 et l'étude de cas 2.

Euphresco est un réseau international d'organisations qui financent des projets de recherche en santé des plantes. L'objectif global est de soutenir la coordination et la collaboration dans le domaine de la recherche phytosanitaire et de maintenir un réseau à long terme d'acteurs de la recherche. Plus de 70 organisations de plus de 50 pays sont membres d'Euphresco. En travaillant en collaboration et en se coordonnant au niveau national, les pays peuvent accéder à des équipements, des ressources ou une expertise spécialisés, ce qui signifie que davantage de progrès peuvent être réalisés pour réduire l'effet des phytoravageurs sur l'économie, l'environnement et la santé des citoyens de chaque pays et aussi au niveau Niveau européen et international.

Defra s'est engagé avec le réseau Euphresco depuis sa création en 2006. Au cours de l'exercice 2022 à 2023, Defra a versé plus de 230 000 £ à des organisations de recherche britanniques menant ou participant à des travaux dans 13 projets de recherche Euphresco dans 29 pays. Par exemple, Fera Science Ltd co-dirige actuellement un projet avec Plant and Food Research, Nouvelle-Zélande pour développer des évaluations préventives d'éventuels agents de lutte biologique contre les ravageurs prioritaires avant leur arrivée. Le projet implique 17 partenaires dans 12 pays et a développé un cadre et envisagé des approches de lutte biologique pour 12 ravageurs.

Le Centre for Forest Protection (CFP) a été lancé en mai 2022 avec pour mission d'améliorer la résilience des forêts, des terres boisées et des arbres du Royaume-Uni et de les protéger des menaces environnementales et socio-économiques, grâce à la fourniture de preuves, de recherches interdisciplinaires, de conseils d'experts et de formation. .

Le centre virtuel est dirigé par les jardins botaniques royaux de Kew et Forest Research et rassemble l'expertise en matière de santé des arbres du Royaume-Uni et du reste du monde.

Entre 2022 et 2025, Defra contribue plus de 5 millions de livres sterling pour soutenir 14 projets de recherche, dont 4 doctorats et 8 stages. Les projets se concentrent sur de nouvelles approches de la santé des arbres et encouragent fortement la collaboration internationale. Ce financement soutient également le développement d'une nouvelle maîtrise en protection des forêts et d'une série de nouveaux modules de formation professionnelle et technique. Le CFP a son propre site Web qui hébergera un centre de connaissances. Une grande partie de la recherche sur la résilience des arbres et des terres boisées est menée dans le cadre du PCP, en particulier des études combinant des approches génomiques et d'autres approches pour comprendre les possibilités d'arbres plus tolérants aux ravageurs et aux maladies, comme le dépérissement du frêne, la maladie hollandaise de l'orme et le chêne aigu. déclin.

UK Research and Innovation (UKRI) est un organisme public non départemental qui regroupe les 7 conseils de recherche disciplinaires, Research England et Innovate UK. L'UKRI investit dans l'innovation et la recherche fondamentales, stratégiques et appliquées, y compris les programmes à long terme de recherche stratégique. Dans la mesure du possible, Defra travaille avec UKRI pour atteindre nos objectifs communs. Par exemple, le Conseil de recherche sur la biotechnologie et les sciences biologiques (BBSRC), le Conseil de recherche sur l'environnement naturel (NERC), le Defra et le gouvernement écossais ont récemment cofinancé le programme de 19 millions de livres sterling sur les maladies bactériennes des plantes. La première phase était le projet de recherche BRIGIT de 5 millions de livres sterling pour comprendre les voies de transmission potentielles de Xylella. La deuxième phase comprend 8 projets qui s'attaquent à une série de menaces pour les cultures et les arbres causées par les pathogènes bactériens des plantes. De même, le programme NERC Future of UK Treescapes a débuté en 2021 et fournit 14,5 millions de livres sterling pour des projets, des bourses et des activités d'échange de connaissances afin d'éclairer la prise de décision sur l'expansion et la résilience des paysages arborés actuels et futurs. Il est cofinancé par les gouvernements Defra, gallois et écossais, le Arts and Humanities Research Council (AHRC) et le Economic and Social Research Council (ESRC).

Figure 4 : Chercheur capturant et identifiant des cercopes pour le projet de recherche BRIGIT (source : John Innes Centre).

L'International Plant Sentinel Network (IPSN) a été créé en 2013 en tant que collaboration entre les jardins botaniques et les arboretums et les scientifiques de la santé des plantes du monde entier. IPSN est coordonné par Botanic Gardens Conservation International (BGCI), avec actuellement plus de 80 jardins participants de plus de 20 nations. Le soutien de Defra Plant Health à l'IPSN vise à faciliter notre surveillance internationale, en recueillant des preuves pour combler les lacunes dans les connaissances sur les phytoravageurs et pathogènes nouveaux et émergents. Par exemple, surveiller la propagation de l'agrile du frêne en Europe de l'Est. L'IPSN cherche également à améliorer les capacités et le renforcement des capacités, en offrant une formation scientifique et des ressources en soutien à la santé des plantes.

Defra a investi dans le projet Living Ash, un partenariat de collaboration de 5 ans entre le Future Trees Trust, Forest Research, Royal Botanic Gardens Kew et Fera Ltd jusqu'en 2024. Le projet Living Ash identifie les arbres avec un degré élevé de tolérance au dépérissement des cendres. , en collectant du bois greffé et en le replantant dans une archive nationale sur le domaine forestier public pour des recherches ultérieures. Le Future Trees Trust et Forest Research travaillent avec Kew pour sélectionner les arbres et étudier les techniques permettant de prélever avec succès des boutures de frêne afin d'éviter le besoin de greffe. L'équipe travaille également avec Fera Science Ltd pour étudier la composante chimique des arbres et identifier les molécules associées à la tolérance.

Le partenariat Action Oak a été lancé en 2018 pour mener des travaux et des recherches vitaux pour protéger nos chênes indigènes et préserver leur avenir. Actuellement, plus de 30 organisations différentes sont impliquées dans Action Oak, et il a soutenu le financement de 11 doctorats. Le comité de pilotage est composé de :

Le partenariat est conçu pour être collaboratif, innovant et engagé dans la recherche. Il encourage l'échange de connaissances et partage les résultats avec les praticiens, sensibilise le public et l'appréciation de nos chênes indigènes et du rôle important qu'ils jouent dans notre paysage.

Observatree est une approche collaborative pour accroître la surveillance et la notification de la santé des arbres et soutenir le travail des professionnels de la santé des végétaux. Dirigé par Forest Research, Observatree rassemble les compétences et l'expérience de la Forestry Commission, de la Scottish Forestry, du gouvernement gallois, du Defra, de l'APHA, de Fera Science Ltd, du National Trust et du Woodland Trust. Les bénévoles d'Observatree forment un réseau britannique de plus de 200 scientifiques citoyens qui entreprennent une série d'enquêtes pour aider à repérer de nouveaux ravageurs et maladies des arbres et à surveiller la propagation de ceux qui existent déjà. Les volontaires sont soutenus par une gamme de ressources de formation de haute qualité et accessibles qui se concentrent sur l'identification et le signalement des ravageurs et des maladies prioritaires les plus préoccupants.

Le UK Plant Health Evidence Co-ordination Group est une composante essentielle du UK Plant Health Service (PHS) et coordonne les activités de recherche pour éclairer l'évaluation officielle des risques, la réponse aux épidémies et les stratégies de surveillance. Le groupe est co-présidé avec les administrations décentralisées et vise à se concerter sur les besoins en données probantes et leur fourniture dans l'ensemble du cadre de gouvernance (figure 5). Le groupe de coordination des preuves phytosanitaires examine la meilleure façon de répondre à ces besoins en matière de preuves de manière coordonnée en partageant les exigences et les résultats de la recherche avec les groupes de preuves phytosanitaires sur les éclosions (qui les fournissent ensuite par l'intermédiaire des équipes de gestion des incidents), les programmes de recherche et de développement en santé des végétaux dans le Defra, en Écosse et en Irlande du Nord, et les programmes de preuves externes, par exemple l'UKRI et la Science and Innovation Strategy for British Forestry (SIS) de l'UKRI et de la Forestry Commission. Des commentaires sont fournis par les principaux ministères gouvernementaux et les équipes de gestion des incidents.

Veuillez vous référer à l'annexe 3 du cadre commun britannique provisoire sur la santé des végétaux pour un aperçu complet de la structure de gouvernance de la santé des végétaux au Royaume-Uni.

Figure 5 : Représentation simplifiée de la façon dont le groupe de coordination des preuves phytosanitaires rassemble les besoins en preuves du comité de préparation aux épidémies phytosanitaires et du groupe sur les risques phytosanitaires, tous au sein de l'organisation nationale de protection des végétaux du Royaume-Uni.

En outre, Defra entretient des discussions informelles continues avec des recherches commandées en Écosse, au Pays de Galles et en Irlande du Nord, telles que celles menées par le Scottish Plant Health Centre.

La recherche sur la santé des arbres est également un thème prioritaire de la stratégie scientifique et d'innovation pour la foresterie en Grande-Bretagne. Sa prestation est dirigée par Forest Research et est coordonnée par les 3 nations dans le cadre d'accords de décentralisation et de mécanismes de gouvernance auxquels Defra participe.

Au sein du Defra, l'équipe des preuves et de l'analyse de la santé des végétaux coordonne les activités de recherche et de développement en santé des végétaux avec d'autres équipes de preuves et sous la supervision de l'équipe scientifique centrale du Defra. Il existe une liaison étroite avec les équipes travaillant sur la foresterie, la santé animale, l'agriculture, l'horticulture, les pesticides et les espèces non indigènes envahissantes pour s'assurer que la commande de recherche complète, plutôt que duplique, les activités. Par exemple, les recherches sur la gestion des bioagresseurs non réglementés des cultures sont portées par les équipes agronomiques et phytosanitaires du Defra avec qui la lutte intégrée est une priorité commune. L'adaptation des arbres, des forêts et des terres boisées aux menaces biotiques et abiotiques est une priorité conjointe avec l'équipe forestière du Defra. Nous travaillons également en étroite collaboration avec d'autres clients de la recherche sur la santé des végétaux tels que Forestry Commission.

Notre programme de recherche est également coordonné avec d'autres activités de recherche sur la santé des plantes financées par le gouvernement, y compris l'UKRI par le biais du partenariat britannique pour la santé animale et végétale et des discussions bilatérales. Des quantités importantes de recherche sur la santé des végétaux sont financées par d'autres. L'UKRI soutient l'innovation et la recherche fondamentales, stratégiques et appliquées, comme indiqué dans la stratégie de l'UKRI (2022 à 2027), en mettant l'accent sur ses 6 thèmes stratégiques. Le BBSRC fournit un soutien stratégique, qui comprend le développement d'installations et d'infrastructures de recherche, à plusieurs centres de recherche, dont le John Innes Centre, Rothamstead Research, Earlham Institute et l'Institut des sciences biologiques, environnementales et rurales. En outre, le Plant Health Institute Strategic Program est un programme inter-instituts entre le John Innes Center et le Sainsbury Laboratory, qui se concentre sur la recherche pour comprendre les mécanismes d'infection des plantes par des agents pathogènes, connaissances qui sont utilisées pour stimuler le développement des cultures. plus résistant aux maladies. Une part importante de la recherche fondamentale est également menée par la communauté universitaire au sens large, en particulier dans les universités.

De plus, des activités de recherche et de développement sont menées par un large éventail de fournisseurs publics, commerciaux et sans but lucratif pour répondre à leurs propres besoins phytosanitaires. Son expertise couvre les secteurs de la foresterie, de l'horticulture, de l'agriculture et de l'environnement. Les exemples incluent le développement agricole et le service de conseil (ADAS), la Royal Horticultural Society, le Tree Council et le Woodland Trust. Nous collaborons étroitement avec ces groupes, par exemple via notre Tree Health Policy Group et notre Plant Health Advisory Forum. Une carte simplifiée de ce paysage élargi de la recherche sur la santé des végétaux est fournie à la figure 6.

Figure 6 : Carte simplifiée du système de recherche en santé des végétaux.

Ce chapitre décrit les recherches futures nécessaires pour soutenir la réalisation des objectifs politiques et des responsabilités statutaires du Defra. 6 thèmes de recherche liés sont proposés. Pour chaque thème, les besoins de haut niveau sont décrits, suivis de domaines d'intérêt plus spécifiques. Les questions de recherche indicatives ne sont pas prescriptives, car les besoins en données probantes changeront avec le temps, mais elles fournissent un guide sur les lacunes actuellement identifiées en matière de connaissances ou d'outils. Ces besoins en données probantes seront davantage hiérarchisés et affinés pour des appels de commande de recherche spécifiques à l'avenir. Cette section explore les questions de recherche indicatives pour chaque domaine d'intérêt dans les 6 thèmes de recherche.

Les activités d'analyse des risques et de l'horizon aident à assurer une meilleure préparation à l'arrivée potentielle de ravageurs et d'agents pathogènes et éclairent l'élaboration de notre régime réglementaire, en particulier la mise en place de mesures phytosanitaires.

Soutenus par le UK Plant Health Risk Group (PHRG), les propres analystes de Defra évaluent et surveillent les menaces de ravageurs et de maladies individuels à l'aide du UK Plant Health Risk Register. Cependant, d'autres approches de recherche sont nécessaires pour comprendre la biologie des ravageurs et des agents pathogènes, les facteurs de risque et les voies, la modélisation climatique et la vulnérabilité de l'hôte afin de nous permettre de mieux comprendre les impacts et les comportements probables des ravageurs connus et des nouvelles menaces et de nous y préparer.

Thème 1 questions de recherche indicatives classées selon les besoins de haut niveau auxquels elles répondent :

Le coût de l'éradication des ravageurs et des maladies des plantes après leur entrée dans le pays est bien supérieur au coût de leur prévention. Par conséquent, notre régime de réglementation interdit ou contrôle les importations de végétaux à risque élevé, d'autre matériel de plantation, de produits végétaux, de bois et de produits du bois. Les inspections à l'importation aident à confirmer la conformité et fournissent des renseignements sur d'éventuels problèmes nouveaux et émergents. Pour assurer les approches les plus efficientes et les plus efficaces, il faut développer et valider des méthodes de détection et de diagnostic et utiliser la modélisation pour optimiser l'échantillonnage.

Bien que les contrôles aux frontières soient importants, les ravageurs et les maladies peuvent être difficiles à détecter ou latents lorsque les matériaux traversent la frontière. De plus, certains ravageurs et maladies peuvent arriver indépendamment, par exemple par voie aérienne. Le régime comprend donc également des inspections dans les pépinières et une surveillance plus large dans les environnements urbains et ruraux, y compris la surveillance aérienne et la science citoyenne. Là encore, la recherche peut optimiser et valoriser ces activités, notamment par le développement et le déploiement de l'innovation et des nouvelles technologies.

De nouvelles approches de modélisation de la distribution et de la propagation des ravageurs et des agents pathogènes émergents et existants au Royaume-Uni constituent également un besoin prioritaire.

Thème 2 questions de recherche indicatives classées selon les besoins de haut niveau auxquels elles répondent :

Figure 7 : Chercheurs évaluant les espèces d'Ips sur le terrain (source : Forest Research)

Le Plant Health Outbreak Readiness Board (PHORB) supervise l'élaboration de plans d'urgence génériques et spécifiques aux ravageurs pour assurer des réponses rapides et efficaces en cas d'épidémie, y compris la législation et des conseils pour l'industrie et les propriétaires fonciers. La recherche peut faciliter le développement de traitements appropriés ou de stratégies de gestion pour éradiquer ou réduire les risques et permettre le rétablissement. Cela devrait inclure la gestion intégrée des ravageurs et des maladies, des solutions fondées sur la nature telles que la lutte biologique, des conseils et des boîtes à outils pour les propriétaires fonciers et des outils de gestion des données.

Thème 3 questions de recherche indicatives classées selon les besoins de haut niveau auxquels elles répondent :

La résilience et l'adaptation sont essentielles à la santé et à la durabilité à long terme de nos écosystèmes sous la pression accrue des ravageurs et des maladies. La recherche peut aider à améliorer la diversité, la santé, l'état et la connectivité des plantes et des écosystèmes pour renforcer la résilience contre les ravageurs et les maladies. La recherche nous aidera également à améliorer notre compréhension de la variation génétique des plantes et de la base génétique de la tolérance des plantes aux ravageurs et aux maladies.

Thème 4 questions de recherche indicatives classées selon les besoins de haut niveau auxquels elles répondent :

Comprendre ce qui motive et contraint les individus et les groupes à obtenir des résultats phytosanitaires positifs et une bonne biosécurité. Combler le fossé entre les connaissances et l'action et améliorer notre connaissance des valeurs économiques, environnementales, sociales et culturelles des plantes saines.

Thème 5 questions de recherche indicatives classées selon les besoins de haut niveau auxquels elles répondent :

Développer des cadres d'évaluation, des indicateurs et des mesures pour nous aider à mesurer les effets de nos politiques, programmes et projets de santé des végétaux.

Thème 6 questions de recherche indicatives classées selon les besoins de haut niveau auxquels elles répondent :

Depuis que le dépérissement des cendres a été découvert en Grande-Bretagne en 2012, Defra a financé des recherches pour comprendre la résistance génétique au champignon du dépérissement des cendres et pour collecter des arbres présentant un certain degré de résistance dans une archive vivante pour un futur programme de sélection potentiel. Les travaux récents ont inclus Royal Botanic Gardens Kew, Future Trees Trust, Forest Research et Fera Science Ltd en tant que partenaires, tandis que les travaux antérieurs impliquaient le cofinancement de subventions BBRSC et NERC à des institutions telles que : l'Institut Earlham, l'Université Queen Mary de Londres, l'Université d'Oxford et du John Innes Centre.

La recherche génétique a abouti au séquençage du génome des frênes[note de bas de page 1], la séquence du génome du champignon[note de bas de page 2], l'identification des emplacements dans le génome du frêne que l'on pense être associés à la résistance au champignon[note de bas de page 3] et d'autres données sur le nombre de frênes susceptibles de mourir [note de bas de page 4]. Cette nouvelle compréhension éclaire l'exploration des stratégies de rétention des cendres dans les paysages britanniques. Le Defra a également consulté le public et les parties prenantes britanniques sur l'acceptabilité de différentes solutions génétiques aux épidémies d'arbres[note de bas de page 5].

Ce corps de recherche sur le frêne a développé des moyens innovants d'utiliser de nouvelles technologies et analyses génomiques pour les problèmes de santé des arbres, qui sont maintenant déployées pour d'autres espèces d'arbres par le biais du Centre de protection des forêts. Le Royaume-Uni dispose désormais d'une capacité phytosanitaire de classe mondiale dans le domaine de la génomique de la résistance aux agents pathogènes des arbres.

Parallèlement, l'archive Ash a été développée dans le cadre du projet Living Ash, qui a mené les plus grands essais de dépistage au monde pour les arbres résistants et a planté plus de 3 000 arbres de 1 000 génotypes dans l'archive. Ils ont été tirés d'une vaste étendue géographique, et de nouveaux arbres continueront d'être ajoutés, afin de maximiser la diversité génétique de la collection et de faciliter la possibilité d'un futur programme de sélection de frênes résistants.

Ensemble, ces recherches s'alignent sur nos objectifs stratégiques visant à améliorer la compréhension des problèmes de santé des végétaux, à développer et à déployer l'innovation et les nouvelles technologies et à fournir une capacité de recherche en santé des végétaux de classe mondiale.

Le chapitre 1 a décrit nos objectifs stratégiques de recherche, qui sont les suivants :

Ce chapitre décrit comment le programme de recherche sur la santé des plantes du Defra sera développé pour atteindre nos objectifs stratégiques.

Defra continuera à participer et à s'engager de manière proactive dans les collaborations de recherche décrites au chapitre 2 pour atteindre nos objectifs stratégiques et optimiser les résultats de notre recherche.

La collaboration et la coordination avec d'autres bailleurs de fonds continueront également d'assurer la complémentarité des approches et la meilleure utilisation des ressources pour atteindre nos objectifs communs. Des domaines d'intérêt communs ont déjà été identifiés avec l'UKRI et ceux-ci seront développés en de nouvelles activités de recherche cofinancées tangibles dans le cadre de la réalisation de ce plan de recherche. De nouvelles approches de cofinancement de la recherche seront poursuivies, par exemple en soutenant un nouveau poste pour mobiliser des fonds supplémentaires pour Action Oak.

La collaboration entre les chercheurs en santé des plantes, tant au pays qu'à l'étranger, sera facilitée par un soutien continu à des réseaux tels que Action Oak, FPPH et Euphresco. Cela donnera accès à une infrastructure, une expertise et des ressources de recherche de classe mondiale et garantira que les chercheurs apprennent les uns des autres. Cette ambition sera notamment soutenue par le Centre for Forest Protection, qui a pour vision de devenir un hub mondial et qui rassemble déjà les installations et l'expertise de Royal Botanic Gardens Kew et Forest Research avec des partenaires tels que BiFor et INRAE-BETA France. Le cas échéant, et d'un avantage significatif, Defra peut également aider les chercheurs britanniques à participer à des réseaux de recherche financés par l'UE.

La conception conjointe de projets de recherche et l'échange de connaissances tout au long de la durée de vie du projet sont essentiels pour garantir que les problèmes sont pleinement compris et que des solutions appropriées sont développées, partagées et mises en œuvre pour un effet maximal.

Au niveau du programme, nous consulterons les équipes politiques et les agences de prestation tout au long du cycle du projet pour nous assurer que les appels de recherche répondent à leurs besoins. Defra soutiendra des événements d'échange de connaissances tels que la série de séminaires sur le projet FPPH et une réunion annuelle de recherche FPPH. Un événement sur la recherche en santé des plantes sera organisé en 2023 afin de réunir les fournisseurs de recherche et les utilisateurs de la recherche pour discuter des besoins en santé des plantes. En outre, un nouvel espace dédié sur le portail de la santé des végétaux sera développé pour mieux partager les résultats de recherche des activités financées par le Defra. Le Centre pour la protection des forêts sera soutenu pour développer son centre de connaissances en ligne et la traduction des résultats de la recherche en matériel d'éducation et de formation.

Les projets de recherche financés par le Defra continueront d'être tenus de démontrer une co-conception appropriée, en s'inspirant de projets phares tels que le projet sur la processionnaire du chêne (OPM) décrit dans l'étude de cas 2. Tous les projets de recherche nécessiteront un plan de transfert et d'échange de connaissances. Les projets sont tenus de fournir un rapport final au Defra pour publication, mais ils sont également fortement encouragés à présenter les résultats de la recherche aux parties prenantes concernées et à publier des publications universitaires évaluées par des pairs.

Figure 8 : Processionnaire du chêne (OPM) (source : The Tree Council)

Placer l'innovation au cœur de notre approche et investir dans des connaissances, des produits et des technologies de classe mondiale contribuera non seulement à protéger la santé des plantes, mais aussi à stimuler la croissance scientifique et à créer des emplois qualifiés pour notre secteur.

Grâce à nos approches interdisciplinaires et multidisciplinaires, les opportunités d'utiliser la science de pointe et les technologies émergentes peuvent être identifiées et appliquées aux défis de la santé des plantes. Par exemple, les progrès de la génomique ont révolutionné la science de la santé des plantes. Les diagnostics ADN progressent rapidement, avec la capacité de détecter rapidement des agents pathogènes dans différents milieux et de comprendre l'épidémiologie des épidémies de ravageurs et de maladies. Cependant, des défis et des opportunités subsistent pour intégrer ces technologies dans notre régime de biosécurité. Defra continuera à travailler avec des partenaires de recherche pour améliorer ces innovations et évaluer la faisabilité de leur application dans un contexte opérationnel de routine. Notre recherche doit non seulement développer de nouvelles technologies, mais également valider, assurer la qualité et optimiser les technologies pour s'assurer qu'elles sont efficaces et offrent un bon rapport qualité-prix.

Il existe des obstacles à l'adoption de nouvelles technologies dans notre régime phytosanitaire et nos industries et nous nous efforcerons de les comprendre et de les résoudre activement. Par exemple, les producteurs de plantes peuvent ne pas avoir les compétences ou la sécurité financière nécessaires pour prendre des risques avec les nouvelles technologies et ont indiqué qu'ils avaient besoin de soutien par le biais de projets pilotes et de démonstration. Nous allons définir et viser à lancer un fonds d'innovation pour comprendre et surmonter certains de ces défis et obstacles au marché.

Toutes les ambitions décrites dans ce plan sont fondées sur l'hypothèse qu'il existe une communauté florissante de chercheurs qualifiés en santé des plantes et des centres de recherche bien dotés en ressources disponibles pour répondre aux besoins de recherche. Cependant, des rapports antérieurs ont noté la nécessité de développer des compétences en santé des végétaux et de créer une communauté plus large de professionnels de la santé des végétaux formés, et ce besoin demeure. Par conséquent, un élément fondamental du plan de recherche et de développement en santé des plantes du Defra consiste à assurer un vivier de compétences et à former la prochaine génération de chercheurs en santé des plantes.

Les projets de recherche commandés par le Defra offrent aux chercheurs à tous les niveaux d'importantes opportunités de poursuivre leurs travaux. En outre, nous soutiendrons activement des interventions spécifiques pour développer les capacités scientifiques. Au cours de l'exercice 2022 à 2023, le Defra a fourni un soutien financier à 14 doctorants sur des sujets allant des effets potentiels de Xylella sur les arbres indigènes à la modélisation des réseaux commerciaux de plantes et de leurs effets sur les maladies des plantes. Le Defra continuera à soutenir les étudiants, par exemple en travaillant avec l'UKRI et d'autres pour soutenir les partenariats de formation doctorale. Au cours de l'exercice 2023 à 2024, Defra soutient également les bourses NERC Future Treescapes et une bourse Plant Health Future Leader à Kew.

Les programmes de formation, les apprentissages et les stages sont également importants pour développer des compétences plus larges en matière de santé des végétaux. Au cours de l'exercice 2022 à 2023, Defra a financé 8 stagiaires à Kew and Forest Research par l'intermédiaire du Center for Forest Protection et espère répéter ce programme dans les années à venir. Le Centre lancera également à la fois un nouveau master ès sciences en protection des forêts et des options de formation professionnelle d'ici 2025.

Defra soutient également la capacité fondamentale des sciences de la santé des végétaux au sein du gouvernement, par exemple, par le biais d'investissements dans de nouveaux biens d'équipement et des projets d'infrastructure tels que le Forest Research Holt Laboratory.

Defra reconnaît la grande valeur des collections à long terme, y compris les collections de diagnostic de Fera Science Ltd, les collections d'entomologie et de pathologie de Forest Research et les vastes collections des jardins botaniques royaux de Kew, et, le cas échéant, contribue au maintien et à l'utilisation à long terme des collections. lieux d'études.

Ce projet, dirigé par Fera Science Ltd et Forest Research, financé par le programme Future Proofing Plant Health du Defra, vise à développer et à tester des méthodes de contrôle de la chenille processionnaire du chêne (OPM) qui pourraient fournir des alternatives au traitement chimique standard. Le projet a adopté une forte approche de co-conception, travaillant avec les parties prenantes pour s'assurer que les stratégies alternatives sont appropriées et acceptables pour la mise en œuvre sur le terrain. L'engagement des parties prenantes dans la conception expérimentale a créé des opportunités dès le départ pour développer des options de contrôle OPM qui répondent aux besoins de ceux qui gèrent l'OPM et qui sont sensibles aux différents contextes et risques où l'OPM est présent. Celles-ci comprennent des solutions fondées sur la nature, l'utilisation de phéromones pour perturber le comportement d'accouplement et des biopesticides qui peuvent fournir un contrôle plus ciblé et moins nocif pour les organismes non ciblés que les méthodes actuellement utilisées. Des groupes de travail avec une forte participation des utilisateurs finaux et des parties prenantes soutiennent la recherche en cours, permettant un partage efficace des connaissances et augmentant la probabilité d'adoption et de déploiement des différentes méthodes étudiées. Le projet a également été lié à des projets similaires en Europe, dans le but de partager les résultats pour améliorer la protection contre ce ravageur dans tous les pays participants.

Parallèlement à ce projet, Defra soutient 2 doctorants pour étudier d'autres options et renforcer les compétences dans ce domaine. Le premier, basé à l'Université de Newcastle, a étudié le parasitisme des chenilles OPM par Carcelia iliaca qui affecte les œufs, les larves et les pupes OPM. Le doctorant développe un test robuste d'amplification isotherme médiée par boucle (LAMP) pour tester le parasitisme ainsi que pour cartographier la distribution de C.iliaca et ses implications pour les décisions de gestion. Le deuxième doctorant, basé à Fera Science Ltd, vise à développer des biopesticides sélectifs à utiliser contre une gamme de mites nuisibles pour aider à réduire l'utilisation de pesticides chimiques sans augmenter les effets sur les espèces non ciblées dans les chênes.

Une gamme d'approches de mise en service et d'approvisionnement continuera d'être utilisée pour nous permettre de travailler avec un éventail aussi large que possible de prestataires de recherche, tout en répondant à nos besoins de livraison des projets dans les délais.

Les spécifications de recherche seront élaborées selon les besoins pour répondre aux besoins spécifiques et celles-ci seront fournies via des attributions directes ou des appels d'offres ouverts, selon le cas. Le nouveau cadre de développement de la recherche et d'approvisionnement en preuves du Defra est particulièrement utile à cet égard et constituera un moyen important pour l'approvisionnement futur en recherche. Nous continuerons également à utiliser le cadre de modélisation de la santé animale et végétale de Defra et la relation stratégique de Defra avec Fera Science Ltd, en tant que coentreprise, pour la prestation de services de recherche et développement appliqués et réactifs. Le cadre de modélisation de la santé animale et végétale permet au Defra de commander une modélisation à des experts en santé végétale en cas d'épidémie ou d'évaluer les stratégies de lutte antiparasitaire et les niveaux de risque. Les organisations actuellement sur le cadre de modélisation comprennent l'Université de Cambridge, l'Université de Newcastle, Fera Science Ltd, Met Office et le UK Centre for Ecology and Hydrology.

Les partenariats formels entre les organisations gouvernementales basés sur des protocoles d'entente (PE), qui fournissent un soutien aux partenariats de recherche, tels que le partenariat FPPH et le CFP, continueront d'être développés et utilisés le cas échéant. Nous avons également un projet spécifique dirigé par le Met Office axé sur le développement et la validation de modèles de microclimat pour estimer le risque phytosanitaire à l'aide de l'outil Web britannique sur le risque de ravageurs climatiques et évaluer le risque posé par les ravageurs et les agents pathogènes forestiers dans les climats actuels et futurs projetés, à être livré via un protocole d'entente.

Des approches pour offrir des collaborations avec d'autres bailleurs de fonds de recherche afin de tirer le meilleur parti de fonds limités et d'éviter la duplication des efforts seront développées, en particulier avec l'UKRI.

Defra a mis en place un processus d'examen interne et externe complet pour garantir que la recherche de la plus haute qualité est commandée, livrée et publiée, fournissant des preuves pertinentes, fiables et claires.

Différentes approches sont adoptées avec des programmes individuels tels que FPPH, Euphresco et CFP. Cependant, les propositions de projets dans tous les programmes sont modérées et examinées par un panel expérimenté et multidisciplinaire pour s'assurer que les projets peuvent produire la recherche requise selon les normes appropriées et offrir un bon rapport qualité-prix.

Chaque projet de recherche se voit attribuer un responsable du projet Defra qui se réunira au moins une fois par trimestre avec le chercheur principal pour discuter de l'avancement des travaux. Cette période permet de suivre les progrès par rapport aux jalons, de résoudre les problèmes et de discuter régulièrement de l'orientation de la recherche et des opportunités d'optimiser l'échange de connaissances et les effets plus larges du projet. À la fin de chaque projet, les résultats et les résultats des projets sont examinés via un processus de document d'évaluation de projet et d'autres opportunités sont envisagées pour garantir que les résultats du projet sont partagés avec les utilisateurs de recherche concernés et la communauté de recherche au sens large.

Lorsque nous cofinançons des programmes, nous maintiendrons la surveillance en nous engageant activement dans le partenariat. Cela pourrait inclure l'adhésion à des comités de pilotage, via des mécanismes de rapport de programme et un contact direct avec les équipes de recherche.

Toutes les publications de projets financées par le Defra passent par un processus d'examen interne, avec des systèmes disponibles pour faire appel à des examinateurs experts externes lorsqu'une assurance supplémentaire est jugée bénéfique ou nécessaire conformément aux directives du Defra sur les contacts de grande valeur. En plus des publications dans des revues et d'autres résultats de projets, tous les rapports de projet sont rendus publics via la base de données de publication Defra Science.

Figure 9 : Détection d'Ips typographus réalisée par Forest Research (source : Forest Research)

Le suivi et l'évaluation continus sont essentiels pour évaluer les progrès du Defra par rapport aux objectifs et aux engagements énoncés dans ce plan, et pour suivre, mesurer et tirer des enseignements de sa réalisation. Les preuves de succès soutiendront les futures offres de financement, en particulier via des examens complets des dépenses. La théorie du changement, présentée à l'annexe 2, résume la voie prévue pour atteindre les résultats et les impacts escomptés du Defra de ce plan.

La théorie du changement identifie les extrants, les résultats et les impacts que ce plan soutiendra. Il est important de noter que ces impacts sont induits par un large éventail d'actions et d'acteurs impliqués par le « système » phytosanitaire au sens large, et pas seulement ceux impliqués par le plan de recherche et de développement phytosanitaire. A ce titre, l'évaluation de ces impacts sera réalisée dans le cadre de la stratégie de biosécurité végétale pour la Grande-Bretagne (2023 à 2028) et de la stratégie de résilience de la santé des arbres (2018). Le rôle de l'évaluation du plan de recherche et de développement en matière de santé des végétaux est de saisir la contribution d'un ensemble défini d'extrants et de résultats de recherche et de développement à cet ensemble plus large d'objectifs stratégiques.

Le suivi annuel de la livraison des résultats attendus de ce plan de recherche et de développement sera effectué à l'aide d'indicateurs de performance clés (KPI) quantitatifs, à partir de l'exercice 2023 à 2024, et si possible par comparaison avec des références antérieures.

De plus, nous collaborerons avec nos prestataires de recherche pour développer des études de cas et des exemples qualitatifs afin d'illustrer et d'évaluer les progrès vers les résultats décrits dans notre théorie du changement et d'évaluer si et comment les 4 approches de recherche sur la santé des végétaux soutiennent leur réalisation. Les projets à utiliser comme études de cas seront identifiés au stade de la création pour suivre et enregistrer le déroulement des approches dès le début du projet afin que nous puissions apprendre ce qui fonctionne et ce qui ne fonctionne pas au cours du développement d'un projet donné. Les études de cas qui en résulteront comprendront donc à la fois des projets qui ont excellé et ceux qui n'ont peut-être pas fourni tous les avantages escomptés, en mettant l'accent sur l'identification des points d'inflexion qui ont eu un effet critique sur la réalisation des résultats et des impacts. De plus, les projets identifiés comme exemplaires (ou échecs) de nos approches de recherche au milieu ou à la fin de l'étape du projet peuvent également être développés en études de cas, le cas échéant. Nous partagerons ces études de cas avec nos fournisseurs de recherche et nos utilisateurs de recherche pour permettre le développement ultérieur de nos approches.

CFP : Analyse prospective de la santé des arbres - une approche innovante d'analyse prospective pour identifier les menaces émergentes pour les arbres forestiers non indigènes du Royaume-Uni et guider les mesures préventives.

CFP : Prédire le risque pour les espèces d'arbres non indigènes des menaces potentielles au Royaume-Uni - évalue la sensibilité probable des espèces d'arbres non indigènes aux ravageurs et agents pathogènes indigènes, sur la base des distances évolutives entre les espèces végétales indigènes et les hôtes non indigènes potentiels.

FPPH : Enquête sur les hôtes sensibles potentiels pour Phytophthora pluvialis dans les forêts, l'environnement plus large et l'horticulture - générant des listes d'espèces végétales britanniques hôtes sensibles à P. pluvialis.

FPPH : Risque de Phytophthora pluvialis et son potentiel de persistance à long terme dans les forêts affectées - évaluer dans quelle mesure la maladie pénètre l'aubier et si le commerce du bois pourrait être un vecteur. Teste également le potentiel de survie à long terme si aucune espèce d'arbre hôte n'est présente.

FPPH : Évaluation et atténuation des risques associés aux graines prélevées dans la nature - utilise le dépistage biologique et le séquençage à haut débit des graines prélevées dans la nature pour comprendre la communauté microbienne associée et atténuer les risques associés à tout ravageur pouvant être détecté.

CFP : Facteurs de prédisposition abiotiques pour la modélisation spatiale des risques de ravageurs et de maladies - réalisation d'une modélisation spatiale pour identifier la prédisposition environnementale à 3 épidémies importantes de maladies des arbres au Royaume-Uni.

Projet de modélisation Met Office - projet collaboratif créant un modèle visuel de degré de jour et une aide pour cartographier des scénarios tels que l'éclosion des œufs ou les temps de vol des ravageurs importants.

Réseau international de sentinelles végétales dirigé par le BGCI - grâce à des partenariats internationaux, l'IPSN améliore la capacité à long terme de prévenir l'arrivée de nouveaux ravageurs grâce à une détection précoce et une gestion efficace de l'impact.

FPPH : Colonisation des arbres hôtes par Xylella fastidiosa et comparaison des tests de détection des agents pathogènes - évalue la sensibilité d'importantes espèces d'arbres du Royaume-Uni à 3 sous-espèces de X. fastidiosa.

FPPH : La résistance des paysages arborés du Royaume-Uni à l'agrile du frêne - développe une compréhension de la résistance des paysages arborés du frêne du Royaume-Uni à l'alimentation et au développement de l'agrile du frêne.

Euphresco : Extension de l'aire de répartition des scolytes du genre Ips - enquête sur l'expansion de l'aire de répartition d'Ips spp. et la consolidation des facteurs dans une matrice des risques.

FPPH : Évaluer le risque pour la santé des plantes au Royaume-Uni des futures invasions d'Agrilus - un projet de doctorant étudiant quels sont les plus grands risques qu'Agrilus spp. présenter le Royaume-Uni.

FPPH : Modélisation des réseaux commerciaux de plantes et leur réponse aux maladies des plantes - un doctorat financé cartographiant les réseaux commerciaux et utilisant la bioéconomie et la modélisation des données pour développer un cadre des risques dans le commerce des plantes.

Eupresco : Ravageurs et agents pathogènes des conifères transmis par les semences.

FPPH : Identifier et atténuer les futurs risques de Phytophthora au Royaume-Uni - utilise des données communautaires intersectorielles et internationales pour explorer les facteurs qui favorisent la propagation de Phytophthora, comment le climat britannique influencera les espèces émergentes de Phytophthora et tester si la capacité de détection et de surveillance peut être améliorée grâce à des innovations systèmes de métabarcodage.

FPPH : Risques associés au Phytophthora dans les milieux de culture sans tourbe au Royaume-Uni – un projet étudiant les sources potentielles de Phytophthora spp. dans des milieux de culture sans tourbe disponibles dans le commerce.

FPPH : Adaptation d'une nouvelle méthodologie de test COVID pour le dépistage rapide des agents pathogènes des arbres - applique une technologie révolutionnaire initialement développée pour détecter le COVID-19, afin de démontrer que la méthode peut être utilisée pour détecter une gamme d'agents pathogènes microbiens qui causent des maladies chez les arbres.

Euphresco : Développement et validation de techniques rapides et sensibles pour un diagnostic rentable des phytoravageurs – amélioration des méthodologies moléculaires validées pour extraire les virus des tissus hôtes.

FPPH : NepoDetect Direct Detection of Plant Viruses from Vector Nematodes – un projet visant à réduire les temps de traitement en détectant les virus directement à partir des nématodes plutôt que de devoir infecter les plantes avec le nématode sp.

FPPH : Diagnostic rapide des espèces de Phytophthora à l'aide de technologies moléculaires nouvellement développées - démontre de nouvelles façons de détecter les espèces de Phytophthora sur le terrain et de différencier les espèces de Phytophthora en laboratoire.

FPPH : Identification des maladies à Xanthomonas des plantes ornementales - enquête et séquençage de plusieurs Xanthomonas sp. et isolats d'intérêt pour la santé des plantes.

FPPH : Les métabolites des cernes des arbres comme nouvelle méthode de détection des agents pathogènes des plantes - applique des techniques de profilage des métabolites pour quantifier la période d'infection par l'agent pathogène.

FPPH : outil de planification de l'enquête Valitest (épidémies en cours) - compare les processus d'enquête et les exigences de la base de données de l'APHA à ceux de la Commission forestière dans une analyse des lacunes.

FPPH : Potentiel de séquençage à haut débit pour les tests à grande échelle des échantillons d'interception d'importation - applique le séquençage à haut débit aux tests à grande échelle d'échantillons d'interception importants pour les ravageurs et les maladies à haut risque.

Projet Rezatec. FPPH : Détection de Cryphonectria parasitica, niveau d'inoculum sur les sites infectés à l'aide de méthodes de piégeage des spores - applique des méthodes de piégeage des spores pour détecter les niveaux d'inoculum de Cryphonectria parasitica sur les sites infectés.

FPPH: Application de la télédétection pour l'évaluation des virus des cultures à l'échelle du champ - évalue l'efficacité de la télédétection pour la surveillance des cultures à l'échelle du champ pour un certain nombre de cultures avec une gamme de contenu viral.

FPPH : Amplification en cercle roulant pour la détection des virus à ADN – détermination de la meilleure méthode pour détecter les virus à ADN.

Euphresco : Les insectes vecteurs de Xylella fastidiosa - enquête sur les insectes capables de transmettre Xylella d'une espèce hôte à une autre.

FPPH : Une nouvelle approche pour quantifier la sensibilité et la spécificité des citoyens scientifiques dans la surveillance de la santé des arbres - un projet développant une nouvelle méthodologie pour quantifier la sensibilité et la spécificité des citoyens scientifiques qui pourraient être utilisées pour n'importe quelle espèce de ravageur ou de maladie.

Euphresco : Développement d'un outil de diagnostic moléculaire rapide pour évaluer les taux de parasitisme des processionnaires du chêne hautement envahissantes pour la lutte intégrée contre les ravageurs.

FPPH : Développement d'un modèle phénologique d'Ips typographus pour le Royaume-Uni, pour comprendre le nombre de générations possibles dans différentes régions du pays sous différentes prévisions climatiques actuelles et futures.

FPPH : IpsShift modélise l'extension de la gamme Ips, les dommages potentiels et le contrôle avec RangeShiftR en Grande-Bretagne - applique un package R "RangeShiftR" pour modéliser l'extension de la gamme des scolytes européens de l'épinette, les dommages potentiels et le contrôle au Royaume-Uni.

FPPH : Contrôle biologique de la guêpe à galle du châtaignier oriental (OCGW) - libère et surveille le parasitoïde Torymus sinensis pour le contrôle biologique de l'OCGW.

FPPH: Sensibilité de l'épinette de Sitka à Ips typographus - applique de nouvelles méthodes de détection et de quantification d'Ips typographus à partir d'échantillons d'épicéa prélevés à plusieurs endroits en Angleterre.

Euphresco : Lutte contre les virus et viroïdes de quarantaine grâce au nettoyage et à la désinfection.

FPPH : Se préparer à l'agrile du frêne – préparer des méthodes de lutte biologique et chimique à utiliser éventuellement en cas d'introduction de l'agrile du frêne.

FPPH : PhD : Modélisation du développement de l'agrile du frêne en Grande-Bretagne - modélisation de la progression du développement de la vie de l'agrile du frêne dans les conditions britanniques.

FPPH : Comprendre l'importance et les impacts des différentes races de Dothistroma septosporum sur les espèces forestières indigènes et exotiques en Grande-Bretagne - tester s'il existe des différences de virulence observables entre les races de Dothistroma et s'il existe des preuves de spécialisation et d'expression de l'hôte.

FPPH : Impacts du mycovirus Dothistroma sur le comportement et la pathogénicité des agents pathogènes sur les espèces d'arbres forestiers importants sur le plan commercial et écologique - évaluer les effets du mycovirus sur la virulence de Dothistroma, affecte-t-il l'expression des gènes producteurs de toxines et affecte-t-il la sensibilité ?

FPPH : Evaluer la mise en place et l'impact des outils d'accompagnement de la nouvelle politique RBA Processionnaire du chêne (OPM) – la nouvelle politique OPM qui implique une réduction significative du programme d'arrosage. Entré en vigueur en 2022, ce projet vise à évaluer les impacts sur la prise de décision et les actions de gestion.

FPPH : Améliorer les stratégies de gestion pour accroître la résilience des cendres – explore les facteurs importants dans le développement de la maladie du dépérissement des cendres dans les forêts et les haies afin d'améliorer les stratégies de gestion et d'augmenter la résistance des cendres.

FPPH : Phase 2 de l'écologie moléculaire de l'extension d'Ips typographus - établissement d'ensembles de données génétiques de base, test de la variation génétique parmi le nouveau matériel britannique et développement de méthodologies moins complexes pour l'inspection de routine.

FPPH : Méthodes alternatives de contrôle de la processionnaire du chêne (OPM) – tester des stratégies de gestion alternatives pour l'OPM, y compris la confusion sexuelle, les biopesticides et le contrôle naturel.

FPPH : Lutte biologique contre la guêpe orientale du châtaignier (Dryocosmus kuriphilus) – libère et surveille le parasitoïde Torymus sinensis pour la lutte biologique contre la guêpe orientale du châtaignier.

Euphresco : Préparation à la lutte biologique contre les ravageurs prioritaires - établissement d'un réseau de lutte biologique pour partager les connaissances et les informations sur les menaces prioritaires en matière de biosécurité afin d'accroître la préparation.

CFP : Restauration des espèces d'arbres « perdues » et liens culturels – explore le patrimoine culturel et les approches de restauration des espèces d'arbres « perdues » et l'impact de la perte d'espèces.

CFP : Base génétique de l'adaptation du bouleau argenté aux environnements locaux et aux maladies - évalue la base génétique du bouleau argenté pour comprendre leurs trajectoires adaptatives en réponse à l'environnement local et aux maladies.

CFP : Transformer la génomique des cendres : une ressource pan-génome pour une meilleure compréhension de la résistance au dépérissement du frêne - construit une ressource pan-génome pour approfondir notre compréhension de la base génétique de la résistance au dépérissement du frêne chez les frênes britanniques.

FPPH : Comprendre la base génétique de la résilience de Juniperus communis au pathogène envahissant Phytophthora austrocedri - explore la base génétique de la résilience de l'espèce de conifère naïve Juniperus communis au pathogène envahissant Phytophthora austrocedri.

CFP : Résilience à la brûlure des aiguilles Dothistroma dans la population reproductrice du pin sylvestre - applique une analyse génétique quantitative pour explorer et améliorer la résilience à la brûlure des aiguilles Dothistroma dans la population reproductrice du pin sylvestre.

CFP : Distribution et diversité des ormes britanniques existants - collecte et examen des données existantes sur les cultivars d'orme résistants et étude de la diversité génomique des ormes britanniques existants.

CFP : Évaluer les goulots d'étranglement génétiques dans les jeunes forêts plantées et colonisées naturellement - comparer la santé des arbres et la diversité génétique dans les jeunes forêts végétales et naturelles. Recommander des activités d'optimisation pour aider à atteindre le zéro net au Royaume-Uni.

FPPH : Champignons associés aux racines et santé des arbres - test de la présence et de la composition des agents pathogènes fongiques dans les racines du chêne, de l'épicéa et du hêtre au Royaume-Uni et dans 19 pays européens.

CFP : Restauration des espèces d'arbres « perdues » et liens culturels – explore le patrimoine culturel et les approches de restauration des espèces d'arbres « perdues » et l'impact de la perte d'espèces.

FPPH : Améliorer les stratégies de gestion pour accroître la résilience des cendres – explore les facteurs importants dans le développement de la maladie du dépérissement des cendres dans les forêts et les haies afin d'améliorer les stratégies de gestion et d'augmenter la résistance des cendres.

Fonds à résultats partagés : Planter des tees hors des bois - en collaboration avec le Tree Council, Natural England et un éventail d'autorités locales pour tester des approches visant à augmenter la plantation d'arbres hors des bois.

Projet de frêne vivant - collaboration entre Future Trees Trust et Forest Research, pour identifier et gérer des collections d'arbres qui pourraient constituer la base d'un programme de sélection de frênes tolérants au dépérissement du frêne.

Fonds d'innovation pour la production d'arbres - financé par le Fonds Nature pour le climat et géré par la Forestry Commission, soutient l'innovation pour améliorer la qualité, la quantité et la diversité des arbres produits pour la plantation d'arbres.

FPPH : Conversation nationale : vers une culture de la résilience – identification des comportements structurels à la santé des plantes à différentes échelles sociales.

FPPH : Surmonter l'écart entre les connaissances et l'action - en s'appuyant sur un travail de cadrage axé sur les réseaux de connaissances associés à 3 études de cas sur le dépérissement du frêne, Ips typographus et les petites pépinières. À la recherche d'espaces de solutions pour l'application et la diffusion des connaissances.

FPPH : Attention aux lacunes en matière de biosécurité - combler les lacunes et les obstacles à la formation en santé des végétaux.

FPPH : Surmonter l'écart entre les connaissances et l'action - en s'appuyant sur un travail de cadrage axé sur les réseaux de connaissances associés à 3 études de cas sur le dépérissement du frêne, Ips typographus et les petites pépinières. À la recherche d'espaces de solutions pour l'application et la diffusion des connaissances.

FPPH : Mobiliser la science de l'intendance pour améliorer la résilience des forêts - en collaboration avec les développeurs de la plateforme myForest (mF) et les chercheurs de Forest Research pour évaluer la meilleure façon d'établir une communauté de scientifiques de l'intendance (S-Scientists) par le biais d'un laboratoire mF et son potentiel à fournir un outil essentiel échange d'informations.

FPPH: Valeurs sociales et culturelles des arbres et des bois menacés par les ravageurs et les maladies - un examen rapide des preuves des valeurs sociales et culturelles liées aux contextes de gestion des ravageurs et des maladies.

FPPH : Évaluer les coûts de la biosécurité pour la plantation d'arbres à l'épreuve du futur dans les projets de biodiversité et de changement climatique - enquêter sur les besoins et les désirs de biosécurité et s'ils sont actuellement couverts.

FPPH : Évaluation pilote de la santé future des arbres agricoles - évaluer et affiner par la co-conception les différents éléments nécessaires pour susciter les actions requises pour atteindre les objectifs de protection des paysages arborés et de repeuplement pour la résilience.

FPPH : Élaboration d'indicateurs d'objectifs environnementaux de la stratégie de résilience de la santé des arbres et évaluation de l'intégration des données - élaboration de produits de données pour surveiller la réalisation des objectifs environnementaux dans la stratégie de résilience de la santé des arbres (2018).

FPPH : Evaluer la mise en place et l’impact des outils d’accompagnement de la nouvelle politique Processionnaire du chêne Responsible Business Alliance (RBA) – la nouvelle politique Processionnaire du chêne implique une réduction significative du programme d’arrosage – entrée en vigueur en 2022, ce projet vise à évaluer les impacts sur la prise de décision et les actions de gestion.

Évaluation de la stratégie de résilience de la santé des arbres - évaluation de la mise en œuvre de la stratégie de résilience de la santé des arbres (2018).

Cette théorie du changement résume la façon dont les objectifs stratégiques du Defra informent nos activités et approches de recherche (figure 10). Ces activités de recherche génèrent des extrants qui produisent ensuite les résultats et impacts escomptés.

Figure 10 : Schéma simplifié de la théorie du changement.

Nos objectifs stratégiques sont de :

Nous commandons et gérons des activités de recherche sur 6 thèmes de recherche :

Les approches de recherche que nous appliquons lors de la direction des activités de recherche sont :

Nos résultats attendus incluent :

Les résultats que nous avons l'intention de créer incluent :

Nos impacts attendus sont :

Sollars et al. (2017) Séquence du génome et diversité génétique des frênes européens. Nature 541 : 212-216.↩

McMullan et al. (2018) L'invasion du dépérissement des cendres en Europe a été fondée par deux individus génétiquement divergents. Nature Ecologie & Evolution 2 : 1000-1008.↩

Stocks et al. (2019) Base génomique de la résistance du frêne européen au champignon de dépérissement du frêne. Nature Ecology & Evolution 3 : 1686-1696.↩

Cocker et al. (2019) Estimation des taux de mortalité du frêne européen (Fraxinus excelsior) dans le cadre de l'épidémie de dépérissement du frêne (Hymenoscyphus fraxineus). Plantes, Personnes, Planète 1 : 48-58.↩

Jepson & Arakelyan (2017). Élaboration d'une politique de santé des arbres acceptable par le public : perceptions publiques des solutions de sélection des arbres au dépérissement des cendres parmi les publics intéressés au Royaume-Uni. Politique forestière et économie, 80, 167-177.↩